Prosjektoppgave nr. SiS-5

Systembiologi: Reguleringsstrukturer i metabolske nettverk.

Denne oppgaven er meget aktuell i forbindelse med at det planlegges å sette 
igang en stor aktivitet på hele NTNU innen systembiologi.

Oppgaven går ut på å studere i hvilken grad naturen (dvs. biokjemiske 
systemer) bruker foroverkobling og tilbakekobling. Rent konkret mener
Savageau at foroverkobling brukes for en bestemt biokjemisk reaksjon mens
Skogestad mener at det er snakk om tilbakekobling med kaskaderegulering.
Oppgaven vil bl.a. innebære å sette opp en Matlab-modell av de biokjemiske
reaksjonene for en konkret biosyntese. 

Litteratur:
M.A.Savageau, "A theory of alternative designs for biochemical control systems",
  Biomed.Biocgim.Acta, vol. 44, 875-880 (1985)

B.H. Schmidt and E.W. Jacobsen, Identifying feedback mechanisms behind complex cell behavior, IEEE Control Systems Magazine, August 2004, 84-102.